Il n'y a pas de meilleur système d'exploitation (OS). Tout dépend de tes besoins. Il en existe plusieurs dizaines, mais on peut les regrouper sous 2 familles: Windows et UNIX.
I- Microsoft Windows
C'est le système d'exploitation le plus utilisé dans sa version bureau, il est édité par la société Microsoft. Il est plus sensible aux virus que les OS UNIX, mais étant le plus utilisé (dans sa version bureau, encore une fois), les vendeurs de matériel informatique, de logiciels et de jeux-vidéos lui destinent majoritairement leurs produits. Ainsi, la plupart des ordinateurs sont vendus avec Windows dessus (ce qui est totalement illégal en France, c'est de la vente liée), une bonne partie des logiciels ne sont compatibles qu'avec Windows, de même pour les jeux-vidéos. C'est aussi en partie à cause de sa popularité que la majorité des virus lui sont destinés. Il doit généralement être redémarré après chaque installation de logiciel important, ce qui n'est pas (toujours) le cas des OS UNIX.
II- UNIX
UNIX est une grande famille qui regroupe aussi bien Mac OS, les systèmes Linux ou BSD. Les OS de la famille d'UNIX sont moins sensibles aux virus car, entre autres, ils requièrent une autorisation pour toute installation de programme. Mais ça ne veut pas dire qu'il est impossible d'avoir de virus sous Mac OS ou Linux, contrairement à ce que dit plus haut @John Anderson.
Pour la petite histoire, Microsoft a été un temps (avant Windows) un fournisseur de systèmes UNIX, avec son OS XENIX.
1) Mac OS
C'est le système d'exploitation d'Apple, fourni par défaut sur les Macs, mais disponible officieusement sur les autres ordinateurs (inversement, Windows peut s'installer sur un Mac, même si l'ordinateur sera moins optimisé). Il est très utilisé dans le domaine de l'image et de la vidéo (la majorité des films sont montés sous Mac OS, que ce soit des films amateurs ou des superproduction hollywoodiennes). Il est peu utilisé sur les autres ordinateurs que les Macs, et est unanimement reconnu pour son intuitivité.
Si tu es intéressé par la création cinématographique, l'image ou le graphisme en général, il te faut Mac OS. Le développement d'application pour iPhone nécessite également ce système d'exploitation.
2) GNU/Linux pour les puristes, Linux pour les autres
C'est le système d'exploitation le plus utilisé au monde (ce que beaucoup oublient souvent), majoritairement dans sa version serveur. Google, Facebook, Youtube et autres sites sont sur des serveurs qui tournent sous Linux. Il existe plein de "sous-versions" de Linux; la plus populaire est Ubuntu, une version (basée sur Debian) accessible à tous, qui ne nécessite absolument pas d'être commandé via un terminal dont on peut se passer (contrairement à ce que dit, encore une fois, @John Anderson). Il est totalement gratuit et librement modifiable et partageable. Il est basé sur la philosophie du logiciel libre (GNU), c'est-à-dire que la majorité des applications sont libres, généralement gratuites (même si on peut avoir une application libre payante). Linux est réduit par les non-connaisseurs à un simple terminal (c'est-à-dire sans interface graphique, juste des commandes tapées au clavier), ce qu'il était au début (comme tous les vieux OS), et reste pour certaines versions. Il est apprécié des programmeurs car il fourni nombre d'applications de développement, est très stable comparé à d'autres OS comme Windows, et est personnalisable de A à Z (par exemple, alors qu'il est impossible de changer de gestionnaire de fenêtres sous Windows ou Mac OS, c'est possible sous Linux).
Si tu t'intéresse à la programmation, Linux est fait pour toi. Il en est de même si tu veux réutiliser un vieil ordinateur, car comme l'a déjà dit @Léo, Linux est très peu gourmand: il est possible de le faire tourner avec 256Mo de RAM, et 2,6Go de disque dur. En comparaison, il faut 1Go de RAM pour Windows Vista, et plus de 10Go de disque dur...
3) Autres
En dehors de Mac OS et GNU/Linux, les OS de la famille UNIX sont bien moins connus, et très peu utilisés (à l'exception de la famille BSD). Et je ne parle pas des OS mobiles (iOS, Android, ...).
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@pat: tu peux changer la dernière interface d'Ubuntu, la remplacer par GNOME par exemple.
@John Anderson: Windows est bien plus compliqué à prendre en main que Mac OS. Et non "tout" ne peut pas être personnalisé sous Windows, loin de là (c'est l'OS le moins personnalisable).